ตัวอย่างโครงงาน

การศึกษาโครงสรางของเอฟาไวเรนซและการออกแบบ
โมเลกุลอนุพันธโดยวิีธทางเคมีคอมพิวเตอร
ชื่อโครงงาน      การศึกษาโครงสรางของเอฟาไวเรนซและการออกแบบ
       




บทคัดยอ


จากการศึกษาผลของสเตอริโอคอนฟกุเรช่ัน (R)(S) เอฟาไวเรนซและอนุพันธตอคาพลังงานการจัดกับเอ็นไซม HIV – 
Reverse Transcriptase ชนิด wide type โดยระเบียบวิีธโมเลกุลารด็อกกิ้งคพบวา (S) เอฟาไวเรนซและอนุพันธเอฟาไวเรนซอยู
ในชวง -13  ถึง -11 kcal/mol สวนคาพลังงานการจับของ (R) เอฟาไวเรนซอยูในชวง -6  ถึง -2 kcal/mol) ทั้งนี้เนื่องมาจากความ
เหมาะสมของ binding site ซึ่ง binding site ของ (S) เอฟาไวเรนซและอนุพันธมีความเหมาะสมมากกวาและจากการศึกษาผลของ
ตําแหนงของหมูแทนที่ในวงเบนซอกซาซิโนน (benzoxazine-2-one) ของ (S) เอฟาไวเรนซตออันตรกริยาและคาพลังงานการ
จับกับเอนไซน HIV – RT ชนิด wild type โดยระเบียบวิ ีธโมเลกุลารด็อกกิ้งคพบวาอนุพันธของ (S) ในชวง -13  ึถง -11 
kcal/mol) สวนอนุพันธของ (S) เอฟาไวเรนซที่มีหมูแทนที่ในตําแหนงที่ 7 จะจับกับเอนไซน HIV – RT ชนิด wild type  ไดแย
ที่สุด (คาพลังงานการจับอยูในชวง -12 ถึง -9 kcal/mol) ทั้งนี้เนื่องจากโพรงการจับของอนุพันธของ (S) เอฟาไวเรนซที่มีหมู
แทนที่ในตําแหนงที่ 6 เกิดพันธะไฮโดรเจนกับกรดอะมิโน Lys 101  ที่ระยะประมาณ 1.7 A ซึ่งแข็งแรงกวาพันธะไฮโดรเจนที่
ระยะประมาณ 2.0 A ที่เกิดระหวางอนุพันธของ (S) เอฟาไวเรนซที่มีหมูแทนที่ในตําแหนงที่ 7 กับกรดอะมิโน Lys 101  และ
สําหรับอนุพันธของ (S)  เอฟาไวเรนซที่มีหมูแทนที่ในตําแหนงที่ 6 ถาหมูแทนที่มีขนาดใหญเชน –Br , - I  จะทําใหจับกับ
เอนไซม HIV – RT  ีดขึ้นเนื่องจากขนาดใหญของหมูแทนที่จะทําให ึยดโพรงการจับไดแนนขึ้น




วัตถุประสงคของโครงงาน
1. ึศกษาความสามารถในการจัดเก็บเอ็นไซม HIV – RT ของตัวยาตางๆในกลุม NNRTIs 
2. ึศกษาผลของสเตอริโอคอนฟวกุเรช่ัน (R)(S) เอฟาไวเรนซตอคาพลังงานการจับกับ
เอนไซม HIV – RT 
3. ึศกษาผลของตําแหนงของหมูแทนที่ที่ตําแหนงตางๆ ในวงเบนซอกซาซีโนน  
(benzoxazin-2-one) ของเอฟาไวเรนซตออันตรกิิรยาและคาพลังงานการจับกับเอนไซม HIV - RT 


ประโยชนของการใชิว ีธทางเคมีคอมพิวเตอรเขามาชวยในการทดลอง
1. ทําใหการทดลองเปนไปไดดวยความสะดวกรวดเร็วและเปนการลดคาใชจาย
2. สามารถทําการทดลองในบางขั้นตอนที่การทดลองจริงไดไมสะดวก
3. การทดลองทางเคมีคอมพิวเตอรเปนพื้นฐานที่สามารถนําไปพัฒนาไดเชน นําไป

อุปกรณ์ 
1.คอมพิวเตอร์

โปรเเกรมที่ใช้ 
1.microsoft word 2003